中国首次获得寨卡病毒全基因组序列 由赛默飞助力完成测定
2月22日，记者从解放军军事医学科学院获悉，春节期间，中国广东省出现寨卡病毒输入性感染病例后，该院微生物流行病研究所迅即启动应急工作机制，与广州市第八人民医院、出入境检验检疫系统相关单位密切合作，在获得从委内瑞拉归国患者临床标本后，采用高通量测序技术，于2月21日直接从尿液中获得病毒全基因组序列。
据专家介绍，这是中国首次获得寨卡病毒全基因组序列，也是全球首次直接从患者尿液中获得病毒全基因组。该病毒基因组全长10.8kb，系统进化分析表明，属于亚洲世系，与巴西、苏里南、波多黎各等美洲国家流行毒株同源性为99.7%；核苷酸序列比对发现20个突变位点，其中5个突变位点导致氨基酸改变。寨卡病毒全基因组序列的获得，为病毒的溯源和进化提供了重要证据，可用于指导诊断试剂、疫苗和药物的研发，使中国在全球寨卡疫情防控中占得先机。
寨卡(Zika)病毒属于黄病毒属黄病毒科，是一种主要由伊蚊传播的虫媒病毒。1947年首次在乌干达寨卡丛林中的恒河猴体内分离出该病毒，全长基因组序列在2007年被测出。寨卡病毒流行的地理分布、临床表现与登革热、基孔肯雅热十分相近，且均为蚊虫叮咬传播，因此很容易造成误诊。
本次寨卡病毒全基因组序列测定是在赛默飞公司Ion Torrent测序平台完成的， Ion Torrent测序平台是革新性的半导体芯片测序技术平台，通过密布于半导体芯片上的微反应孔和专有的大规模并行芯片感应器，采用独特的氢离子检测原理，使研究人员能够在2至7小时内，获取10Mb到2Gb以上的高[accuracy]度序列。Ion Torrent的化学测序原理简单真实、无修饰的核苷酸、无激光器或光学检测设备，适合多种测序通量的科学研究，在[much]短时间内获得真实可靠的实验结果。
Ion Torrent快速的测序技术为突发事件提供了有力保障，迅速地助力重大疫情的破译和防控，下图为近几年Ion Torrent平台破译的疫情 。
