南京口岸开展基因组测序检测，发现全新环状新病毒
从江苏出入境检验检疫局(以下简称江苏检验检疫局)了解到,近日，该局联合江苏省卫生和计划生育委员会(以下简称江苏省卫生计生委),在对一例经南京口岸入境既往发热患者的生物样本进行病毒宏基因组测序检测时,发现了一种全新的感染人体的环状病毒。
病毒的发现及研究对防治人类和动植物疾病等各方面具重要意义
据悉,这位男性患者是一名从新加坡回国的劳务人员,在经南京禄口国际机场入境时,红外体温监测仪显示其体温超过37℃。南京检验检疫局口岸检疫人员复测确认该男子处于发热状态,立即对其进行了详细的流行病学调查和医学排查,并在知情同意后采集了血液、尿液、唾液等生物学样本。经口岸现场快速筛查和江苏国际旅行卫生保健中心实验室病原体检测,排除了其感染寨卡病毒、黄热病毒、登革热病毒、疟原虫、西尼罗热病毒和基孔肯雅热病毒等多种病原体的可能。
近期,江苏检验检疫局与江苏省卫生计生委联合对口岸既往多份发热患者的生物样本进行宏基因组测序检测,在上述患者的生物样本中发现了一种新型环状单链DNA病毒片段,通过进一步测序、序列组装、PCR扩增,得到完整的病毒基因组。该病毒基因组全长由3018个核苷酸组成,编码2个主要蛋白。经与现有基因库比对,与该病毒[much]相似的为猪粪相关的环状病毒-5(PoSCV5),但其核苷酸同源性仅为84%,氨基酸同源性低于50%。经过专家复核,认为这是一种在人体首次检出的新型环状单链DNA病毒。
对于该病毒的致病性,江苏国际旅行卫生保健中心孙立新博士表示,目前还不能明确该环状病毒与患者所患疾病的关联性。病毒结构与致病性不存在特别关系,不能仅从环状来判断它的致病性有无及强弱;相关性需要做进一步研究才能确定。
目前,江苏国际旅行卫生保健中心和江苏省疾病预防控制中心正在对该病毒进行分离培养,以进一步开展其生物学特征、流行病学特点、可能的致病性等研究,并继续随访该患者及其家属和相关人员,适时进行详细的流行病学调查和生物样本检测工作。
据权威人士介绍,病毒在自然界分布广泛,但直到19世纪末,病毒才开始逐渐被发现和鉴定。目前,国际病毒分类委员会(ICTV)报告认可的病毒有数千种。病毒的发现及研究对防治人类和动植物疾病,以及对分子生物学、细胞生物学、疫苗研制及基因工程等都具有重要意义。
携手构建全链条的口岸传染病防控体系
出入境人员卫生检疫是检验检疫核心工作之一,直接关系公共卫生安全。江苏检验检疫局构建了疫情风险评估、现场检疫查验、实验室检测、信息通报、后续追踪全链条的口岸传染病防控体系。
在口岸一线,检验检疫部门遵循“逢警必处、科学检疫”的旅客检疫规则,做到不同航线飞机分类管理,风险防控,严格检疫,科学处置,保证快速通关又有效维护口岸安全;同时加强与口岸部门合作,确保口岸疫情及时得到理想中处置。江苏局着力提升技术支撑能力,打造全国系统力争上游的口岸卫生监测技术平台,高水平的实验室和专业的检测人员,为一线工作提供了有力的技术支撑,实现“检得出、检得准、检得快”。
